Anna Fijarczyk, PhD 

Associée de recherche / Génomique évolutive
e-mail:
anna.fijarczyk.1 [at] ulaval.ca

Biographie

J’utilise la génomique et la bioinformatique pour étudier l’évolution des champignons et d’autres espèces. Je m’intéresse particulièrement aux mécanismes moléculaires d’adaptation à de nouveaux environnements. J’ai une formation en génétique des populations et j’ai obtenu mon doctorat à l’Université Jagellon de Cracovie, où je me suis concentré sur la reconstruction phylogéographique de la migration d’espèces d’amphibiens. J’ai ensuite rejoint l’Institut des sciences de l’environnement de Cracovie, en Pologne, pour un postdoctorat, afin d’étudier comment le flux de gènes et la sélection balancée façonnent la diversité génétique des gènes immunitaires chez des espèces étroitement apparentées.

 

Intérêts

En 2017, j’ai rejoint le Laboratoire Landry, où j’ai développé un fort intérêt pour les champignons et commencé à travailler dans plusieurs domaines de la génomique fongique :

    1. Étude du rôle de l’hybridation dans l’émergence des pathogènes fongiques (Ophiostoma sp.) qui causent la maladie hollandaise de l’orme (dans le cadre du projet bioSAFE de Génome Canada).
    2. Étude de la spéciation hybride et des taux de mutation chez la levure sauvage Saccharomyces paradoxus.
    3. Étude de l’évolution de la taille et de la complexité du génome chez les champignons pathogènes.
    4. Détection et prévision de la résistance antifongique chez Candida albicans à partir d’échantillons cliniques (projet GAPP de Génome Canada).

Publications

Durand R, Jalbert-Ross J, Fijarczyk A, Dubé AK, and Landry CR. Cross-feeding affects the target of resistance evolution to an anti-fungal drug. PLOS Genetics 19(10): e1011002 (2023)
Konopinski MK, Fijarczyk A, Biedrzycka A. Complex patterns shape immune gene diversity during invasion of common raccoon in Europe — Selection in action despite genetic drift. Evolutonary Applications 16 (1), 134-151 (2023)
Fijarczyk A, Bernier L, Sakalidis ML, Medina-Mora CM, & Porth I. Independent evolution had led to distinct genomic signatures in Dutch elm disease-causing fungi and other vascular wilts-causing fungal pathogens. Journal of Fungi 9 (1), 2; (2022)
Biedrzycka A, Fijarczyk A, Kloch A, & Porth I. Genomic basis of adaptations to new environments in expansive and invasive species. Frontiers in Ecology and Evolution 10, 974649; (2022)
Fijarczyk A, Hénault M, Marsit S, Charron G, & Landry CR. Heterogeneous mutants and spectra in yeast hybrids. Genome Biology and Evolution evab282 (2021)
Marsit S, Hénault M, Charron G, Fijarczyk A, & Landry CR. The neutral rate of whole-genome duplication varies among yeast species and their hybridsNature Communications 12, 3126 (2021)
Fijarczyk A, Hénault M, Marsit S, Charron G, Fischborn T, Nicole-Labrie L, & Landry CR. The genome sequence of the Jean-Talon strain, an archeological tetraploid beer yeast from Québec. G3: Genes, Genomes, Genetics 10 (9), 3087-3097 (2020)
Hallin J, Cisneros AF, Hénault M, Fijarczyk A, Dandage R, Bautista C, & Landry CR.  Similarities in biological processes can be used to bridge ecology and molecular biology. Evolutionary Applications 13 (6), 1335-1350 (2020)
Fijarczyk A*, Hessenauer P*, Martin H, Prunier J, Charron G, Chapuis J, Bernier L, Tanguay P, Hamelin RC & Landry CR. Hybridization and introgression drive genome evolution of Dutch elm disease pathogens. Nat Ecol Evol 4 (4), 626-638 (2020)
Eberlein C*, Hénault M*, Fijarczyk A, Charron G, Bouvier M, Kohn LM, Anderson JB, & Landry CR. Hybridization is a recurrent evolutionary stimulus in wild yeast speciationNature Communications 10 (1), 1-14 (2019)
Fijarczyk A, Dudek K, Niedzicka M & Babik W, Balancing selection and introgression of newt immune-response genes. Proceedings of the Royal Society B 285:20180819 (2018)
Niedzicka M, Dudek K, Fijarczyk A, Zieliński P & Babik W, Linkage map of Lissotriton newts provides insight into the genetic basis of reproductive isolation. G3: Genes, genomes, Genetics 7:2115-2124 (2017)
Fijarczyk A, Dudek K & Babik W, Selective landscapes in newt immune genes. Genome Biology and Evolution 8:3417-3432 (2016)
Nürnberger B, Lohse K, Fijarczyk A, Szymura JM & Blaxter ML, Para-allopatry in hybridising fire-bellied toads (Bombina bombina and B. variegata): Inference from transcriptome-wide coalescence analyses. Evolution 8:1803–1818 (2016)
Niedzicka M, Fijarczyk A, Dudek K, Stuglik M & Babik W, Molecular Inversion Probes for targeted resequencing in non-model organisms. Scientific Reports 6:24051 (2016)
Fijarczyk A & Babik W, Detecting balancing selection in genomes: limits and prospects. Molecular Ecology 24:3529–3545 (2015)
Babik W, Dudek K, Fijarczyk A, Pabijan M, Stuglik M, Szkotak R & Zieliński P, Constraint and adaptation in newt Toll-like receptor genes. Genome Biology and Evolution 7:81–95 (2015)
Elgvin TO, Hermansen JS, Fijarczyk A, Bonnet T, Borge T, Sæther SA, Voje KL & Sætre G-P, Hybrid speciation in sparrows II: a role for sex chromosomes? Molecular Ecology 20:3823–3837 (2011)
Fijarczyk A, Nadachowska K, Hofman S, Litvinchuk SN, Babik W, Stuglik M, Gollmann G, Choleva L, Cogălniceanu D, Vukov T, Džukić G & Szymura JM, Nuclear and mitochondrial phylogeography of the European fire-bellied toads Bombina bombina and Bombina variegata supports their independent histories. Molecular Ecology 20:3381–3398 (2011)