Shotaro Namba, PhD
Stagiaire postdoctoral / Biologie évolutive des systèmes
e-mail: shotaro.namba.1 [at] ulaval.ca
Biographie
J’ai grandi à Okayama, dans la campagne japonaise. Depuis mon enfance, je suis fasciné par les microscopes, et plus particulièrement par l’observation des micro-organismes en mouvement sous l’objectif. Animé par le désir de mieux comprendre ces microbes familiers, j’ai rejoint le laboratoire d’Hisao Moriya en deuxième année de baccalauréat. Je me suis alors passionné pour la génétique des levures, notamment la surexpression génique, et j’ai consacré les sept années suivantes à l’étude de ce champignon microscopique. Pour moi, le plaisir de la biologie réside non seulement dans l’observation des cellules, mais aussi dans leur perturbation et la découverte de leurs réponses à ces perturbation. Au cours de ma thèse, j’ai surexprimé un large éventail de protéines chez la levure et étudié les phénotypes résultants. J’en suis venu à considérer ces phénotypes comme des manifestations directes des contraintes fondamentales de la cellule elle-même. La quantité de protéines qu’une cellule peut tolérer est déterminée par de multiples limitations cellulaires, notamment les ressources intracellulaires disponibles et la capacité limitée des compartiments cellulaires à accueillir correctement les protéines. Mes observations de ces contraintes m’ont progressivement conduit à une question plus vaste : comment le protéome des cellules modernes a-t-il été façonné par l’évolution ? En 2026, j’ai rejoint le laboratoire de Christian pour étudier l’évolution des protéines. Travailler dans ce nouvel environnement me permet de relever avec plaisir les défis liés à l’entrée dans un nouveau domaine et à l’élargissement de mes perspectives.
Intérêts
Mes recherches actuelles portent sur la compréhension de la structure des protéomes cellulaires. Au sein du laboratoire de Christian, je cherche à combiner des approches basées sur la surexpression génique avec un criblage mutationnel à haut débit afin de déterminer quelles sont les propriétés qui font que les gènes ont certains niveaux d’expression et certaines séquences d’acides aminés, et comment ces propriétés ont été établies au cours de l’évolution.
Publications

Namba S, Moriya H. Toxicity of the model protein 3× GFP arises from degradation overload, not from aggregate formation. J Cell Sci 137 (11) jcs261977 (2024)

Namba S, Kato H, Shigenobu S, Makino T, Moriya H. Massive expression of cysteine-containing proteins causes abnormal elongation of yeast cells by perturbing the proteasome. G3 Genes|Genomes|Genetics, Volume 12 (6) jkac106 (2022)
